Lors la diffusion de la première saison sur M6, la série était suivie par 3,8 millions de téléspectateurs en moyenne [1]. Lors de sa seconde saison, ils étaient encore plus nombreux puisque la série fut suivie par une moyenne de 4,1 millions de téléspectateurs [2]. Mais la série connu un véritable envol lors de la diffusion de sa troisième saison, avec une moyenne de 6,4 millions de téléspectateurs. Le dernier épisode de cette saison fut d'ailleurs suivi par 6,9 millions de téléspectateurs, pour 28.3% de parts de marché [3], soit le record absolu d'audience pour NCIS. Dès la fin de la diffusion de cette saison, M6 rediffusa intégralement la série : la série enregistra d'excellents scores, avec des audiences bien supérieures aux autres programmes inédits diffusés par la chaîne. Ainsi, lors de ses rediffusions, NCIS réussissait à rassembler plus de téléspectateurs que la saison deux de Prison Break. Alors que sa diffusion n'a commencé que fin octobre, la quatrième saison bat déjà, elle aussi, tous les records. Ainsi, depuis le début de cette saison, NCIS a battu plus de dix fois la Star Academy [4], alors que cela semblait inimaginable quelques années auparavant. Mieux encore, le 16 novembre, NCIS s'est payé le luxe de se placer devant un match de l'équipe de France de foot. Ainsi, selon Médiamétrie, le programme a non seulement enregistré son record d'audience historique, mais la chaîne a réalisé sa meilleure audience de l'année 2007, avec plus de 7,1 millions de téléspectateurs [5]. L'engouement pour cette série se confirmera lors des rediffusions sur M6 lors de l'été 2008. Ces rediffusions se déroulait en soirée à thèmes réunissant 3 épisodes (par forcément diffusés dans l'ordre chronologique) de saisons différentes et axés sur un personnage particulier de la série (par ex : Soirée "Tony", Soirée "Abby"...). Avec ce type de rediffusion, M6, en se plaçant face à Koh-Lanta, réalise tout de même de bonne audience, se plaçant en 2° position lors des soirées. Par exemple, la soirée spéciale du 4 juillet réunissait 3,8 millions de téléspectateurs, autant que lors de la 1° diffusion de cette série [6].En France, NCIS : enquêtes spéciales est donc devenue la série phare de la chaîne M6, le 6e épisode de la saison 5 réunissant par exemple 7,3 millions de télespectateur le 3 octobre 2008.
Il y a peu la chaine CBS productrice de la série a annoncé qu'elle renouvelle le contrat pour une sixième saison qui devrait compter 28 épisodes (au lieu des 24 prévus). [7
